《仙剑奇侠传3》故事发生在《仙剑》第一代的五十年前,那时侯,李三思刚刚发出赤子的第一声啼哭;巫后还是襁褓中的婴儿,而剑圣,则还没有拜入蜀山修仙……
《仙剑奇侠传3》中事情的起因是从锁妖塔顶端突然坍塌,封印被解除开始的,但是,更深层的因果却要追溯到千年前的神界。神将军飞蓬与魔将军重楼因两界的冲突而屡屡交手,一直难分胜负,两人逐渐有惺惺相惜之意。 重楼提出要和飞蓬在自己发现的一处新仙界中决斗,一较高下,飞蓬碍于神界天规而犹豫再三,最终经不起重楼诱惑而答允。两人势均力敌,比试旷日持久,最终惊动了天庭,天帝派兵捉拿飞蓬问罪,飞蓬因感知到追兵将至而分心,佩剑被重楼打落人间而落败……
光阴荏苒,飞蓬被神界问罪贬为人,经过多次转世成为渝州唐门新安当铺伙计景天。同时,重楼自魔界窥探人间,偶然发现飞蓬的转世如此卑微平凡,心中动念想要帮助景天,于是来到人间,滋扰蜀山,想要帮飞蓬找回佩剑,无意中毁坏了锁妖塔,偶然得到了飞蓬在人间第一世——姜国太子龙阳铸炼的魔剑。景天得到魔剑的同时,结识了唐门小姐雪见,从此改变了自己的生活。一开始被卷入雪见家族的内部斗争以及唐门和霹雳堂的争斗之中,而后遇到蜀山弃徒长卿及其未婚妻紫萱,走上了协助蜀山寻找五灵珠,封印锁妖塔的漫漫征途。一直隐藏在魔剑中的鬼魂化身而出,竟然是景天前世龙阳的妹妹龙葵。几个人的情爱纠葛,生离死别反复交织纠缠,雪见的离奇身世,紫萱不为人知的秘密,龙葵长久以来的心中愿望……伴随着人类与妖界死生存亡的争斗,而其实人的欲望,才是所有纷争的本源。
仙剑奇侠传三是半回合、半即时制的角色扮演游戏。战斗时,角色可选择作的动作可分成五种:
击:即“攻击”,是最基本的攻击,依照个体攻击力、对方的防御力和武器的攻击力而定。击不耗任何东西。
术:即“仙术”,利用五灵仙术攻击敌人。仙术分成五灵:火、雷、风、土、水,按照这个顺序相克(与仙剑系列之前作品有所差异)。
技:即“技能”,是每个角色独特的招术。有时候需要透过特殊剧情获得技能。技能会耗气,气只能借由升等或受到攻击而补充。越高级的技,耗的气就越多。
防:即“防御”,让角色进入防御状态,不攻击,而提高防御力。也可利用防回归起跑点,而等待更好的时机下手。
物:即“物品”,战斗中可以使用物品。物品分三种:恢复性的、攻击性的、状态性的。恢复的可以恢复各种情形,攻击性的可以用来攻击,状态性的可以进入某种状态或解除状态。
援:即“援护”,唯有男主角景天可使用的招数。当景天站在五灵法阵的正中央,而有女主角所剩的精不多时,可发动援。当景天成功援助一位女主角时,好感度会增加。
阵:即“阵列”,在战斗可以改变角色站的五灵法阵位置,可是相对的要付出该角色一回合的时间。
逃:即“脱逃”,俗话说“三十六计,走为上策”,正是此意。当战斗不顺时,就可以逃;但非每次都能成功。