《塞普特拉战记》是一个日式风格浓郁的角色扮演游戏，因此它在人物的描写和故事的情节上具有很强的表现力。与《最终幻想VII》的故事背景类似，都充满着科幻、离奇的色彩。然而《最终幻想VII》的故事基本上是从头讲到尾。而《塞普特拉战记》则不然。整个游戏由十五个章节组成，围绕着一个传说已久的故事而展开。在游戏中玩家有着短期和长期有目标，每一章节都由独立的一个故事自成一体，而把氖章节拼合在一起又构成了整个的完整故事。随着每一个章节的铺开，整个塞普特世界所包含的秘密也会逐渐明朗。尽管游戏是单线的，然而剧情的发展却需要玩家在每个章节中尽量多完成一些副线任务，也只有这样，玩家才可以更加深入地了解塞普特拉。《塞普特拉战记》中的故事神话色彩更加浓厚，世界背景的变化很大。从第一壳层到核心部分，每个壳层都有其独特的地理环境和人文特征。如果说《最终幻想VII》的世界设定还算标准的话，《塞普特拉战记》的世界就用丰富多采来形容了。
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